Εντοπίζεται στο πρόσθιο τμήμα της 3ης κοιλίας, στο κέντρο του εγκεφάλου, σε σημείο τπου εμποδίζει τη φυσιολογική ροή του εγκεφαλονωτιαίου υγρού.
Πρόκειται για μία κύστη, το σχήμα της οποίας θυμίζει ρόγα από σταφύλι και περιέχει ένα κολλώδες υγρό σαν βλέννη.
Η κολλοειδής κύστη μπορεί να προκαλέσει οξύ αποφρακτικό υδροκέφαλο, αυξημένη ενδοκρανιακή πίεση ή ακόμα και αιφνίδιο θάνατο από ανακοκπή, καθώς πιέζει τον υποθάλαμο που ρυθμίζει την καρδιακή λειτουργία.